Fue creado el  29 de septiembre de 1989, por iniciativa del Comandante en Jefe Fidel Castro. Fue  un proyecto que reunió a biólogos, químicos, ingenieros hidráulicos y ambientalistas, entre otros profesionales encargados de llevar a cabo estrategias para la recuperación del río Almendares y su entorno,  que presentaba en esa época un manifiesto deterioro. 

Este Parque cuenta con 700 hectáreas  y una longitud que incluye los últimos 9,5 kilómetros del río Almendares. Lo  integran el antiguo Jardín Botánico Nacional, el parque Almendares,  el Bosque de La Habana, los jardines de la Tropical y de la Polar, respectivamente,  y la Loma del Husilllo. 

Una característica sui  géneris  y que lo diferencia de otros similares en Cuba, incluso en el mundo, es la interferencia poblacional en la que intervienen más de 200 mil personas y 234 centros industriales, hospitales y escuelas, ya que el río y sus afluentes, atraviesan algunos lugares de los municipios  capitalinos del Cerro, Plaza de la Revolución, Playa y Marianao. 

Precisamente por su flora, fauna y los barrios dentro de su territorio lo colocan como un caso atípico respecto a otras instalaciones de iguales funciones en Cuba, en las Américas y en el mundo.

El Parque combina las funciones de esparcimiento, de “pulmón”, por ser el principal emisor de oxígeno hacia varios municipios capitalinos de gran densidad poblacional.